申请中止支付保函项下款项属于特殊保全措施，适用有关诉讼保全措施的管辖规定。如果是诉讼前申请中止支付保函项下款项即由财产所在地的人民法院管辖，如果是诉讼中申请中止付保函项下款项，则由正在审理此案的法院管辖。